学校有六大学系:生物学、化学及化学工程系、工程与应用科学、地质学及行星学、人类学和社会科学、物理数学和天文学。该院研究生课程门门都出类拔萃，物理研究生专业排名第1，化学第1，数学第6，生物学第3，计算机第11，经济学第14。
　　该校科研设施先进，有布斯计算中心、Hale天文台、地震实验室、Kerckhoff海洋实验室、Big Bear太阳系观测站、Palomar天文台、Owens峡谷射电天文台、NASA的喷气推进实验室、环境质量实验室、新成立的位于夏威夷的亚毫米观测站、斯坦福线性加速器具中心等。
　　学院：生物科学学院、工程与应用科学学院、化学与化学工程学院、地质学与行星科学学院、物理学、数学与天文科学学院、人文与社会科学学院。
　　研究中心： 红外线过程分析研究中心（IPAC）、天文学研究中心、材料过程模拟研究中心（MSC）、高级计算研究中心（CACR）、工业关系研究中心、计算机资源研究中心、计算机科学部、生物工

程学部、分子科学实验室、喷气推进实验室（JPN）等科研机构。
　　专业设置：航空学、天体物理学、天文学、材料科学、周围工程学、机械工程学、化学工程学、土木工程学、计算与神经系统学、计算机科学、电机工程学、地震学、地震工程学、生物学、分子生物学、神经科学、地质学、行星科学、化学、物理学、数学、应用物理学、控制与动态系统、管理学、经济学、社会学、人文与社会科学、人类学、历史、语言与文学、地球物理等数十种。