专业学院：

    全校现有18个学院，下属包括178个研究所，以及为医学院实习的诊所。
    • 01 天主教神学院
    • 02 基督教神学院
    • 03 法学院
    • 04 企业经济学院
    • 05 国民经济学院
    • 07 医学院 (包括. 牙医学)
    • 08 兽医学院
    • 09 历史及艺术学院
    • 10 哲学，科学哲学及宗教学院
    • 11 心理学及教育学院
    • 12 文化学院
    • 13/14 语言学及文学院
    • 15 社会学院
    • 16 数学，信息学及统计学院
    • 17 物理学院
    • 18 化学及药学院
    • 19 生物学院
    • 20 地质学院

    官方的院系命名由于历史的原因已经被更改：原先的第六学院林学院已于1999年归入慕尼黑工业大学，第十三及十四学院已合并。

    慕尼黑大学成就突出的学院有企业经济学院、医学院、法学院、社会学学院、物理学院、化学学院、林学院、兽医学院等。 
    课程设置

    大学的教学单位现分为18个学院，这些学院中又分为总共178个研究所,以及为医学院实习用的诊所。慕尼黑大学成就较高的学院主要有企业经济学院、医学院、法学院、社会学学院、物理学院和化学学院、林学院、兽医学院等。